Министерството на финансите категорично оспори твърденията на ГЕРБ за счетоводни манипулации в Агенция "Пътна инфраструктура", като ги класифицира като неверни внушения, лишени от доказателства. Ведомството подчертава, че не разполага с нито един механизъм за промяна на данните и датите на вече издадени сертификати и фактури, още по-малко да ги прехвърля към предходна бюджетна година. Официалната позиция, която напомня становището от 8 септември 2026 г., твърди, че подобни действия са лесно установими като невъзможни и противоречащи на установените със закон практики.
Според финансовото министерство обвиненията за устни указания към АПИ също не съответстват на реалността, а независимостта на Сметната палата е гарантирана от закона и не подлежи на външно вмешателство. Одитният орган извършва проверките си по решение на Народното събрание, докато министерството заявява, че не участва в политически интриги или спекулации, целящи да подвеждат обществото. В името на партийни цели се счита, че се жертва авторитетът на страната чрез разпространяването на такива твърдения.
Контекстът на спора включва изявление от 9 октомври, когато бившият финансов министър Теменужка Петкова съобщи, че ГЕРБ е изпратила сигнал до Европейската комисия по случая. Тя посочи, че в АПИ са открити сертификати за дейности, но липсват фактури от описания от партията тип, което тя интерпретира като доказателство за манипулации. Парламентът е възложил на Сметната палата да провери разходите на АПИ и други институции за периода от 1 януари 2020 г. до 30 юни 2026 г., като резултатите от одита трябва да бъдат внесени в Народното събрание до 30 октомври 2026 г.